Las Agencias Agrarias son órganos desconcentrados de la Dirección Regional de Agricultura, encargadas de efectuar en sus respectivas circunscripciones territoriales, acciones en materia agraria. El ámbito territorial de las Agencias Agrarias está delimitado en base a corredores económicos y a cada una de las provincias que comprenden el Departamento de Madre de Dios. Tiene la capacidad de convocar a los Organismos Públicos Descentralizados del Gobierno Regional Madre de Dios, del Ministerio de Agricultura y Jefes de Proyectos, para facilitar la solución de los problemas de los productores organizados. La Dirección de una Agencia Agraria está a cargo de un funcionario con rango de Director, con categoría inmediata inferior a la del Director Regional.

• Promover la constitución y fortalecer las organizaciones de productores en las principales cadenas productivas.
• Promover la gestión de corredores económicos que lo relacione con su entorno regional.
• Cumplir y hacer cumplir las normas sobre los recursos naturales y de la actividad agraria, en coordinación con las dependencias de los Proyectos y Organismos Públicos Descentralizados del Ministerio de Agricultura.
• Integrar el Sistema Nacional de Información Agraria en la obtención y difusión de información para la gestión de los productores agrarios organizados
• Facilitar a los productores organizados la convocatoria y concertación de entidades de los sectores público y privado para la prestación de servicios de gestión empresarial, comercialización, financiamiento, información para la gestión, asesoría jurídica, capacitación, asistencia técnica, sanidad y de asesoría en sistemas productivos.
• Formular y ejecutar Proyectos de Inversión Publica vinculados al sector agrario en el ámbito regional.
• Participar en la gestión sostenible del recurso hídrico en el marco de las entidades de cuencas y políticas de la Autoridad nacional del Agua.
• Promover, ejecutar proyectos y obras de irrigación, mejoramiento de riego manejo adecuado y conservación de los recursos hídricos y de suelos.
• Promover y prestar servicios de asistencia técnica en sanidad agropecuaria, de acuerdo a las políticas y programas establecidos por la Autoridad Nacional de Sanidad Agraria.
• Fomentar sistemas de protección de biodiversidad y germoplasma.
• Fomentar la investigación, transferencia de tecnología y extensión agropecuaria.
• Coordinar con las dependencias públicas y privadas ambientales de su ámbito el aprovechamiento sostenible de los recursos naturales orientadas a la reducción de la vulnerabilidad y su adaptación al cambio climático en el sector agrario.
• Otras que le sean asignadas por la Dirección Regional de Agricultura.

Unidad de Cultivos, Crianzas y Maquinaria Agrícola.
Unidad de Participación en Gestión Hídrica y Suelos
Unidad de Coordinación Ambiental Agraria